引起胎儿基因突变
孕妇缺硒会影响体内甲状腺激素的代谢，并引起胎儿遗传基因的突变，会导致小儿先天愚型，危害甚多。
另外，孕妇缺硒会使新生儿尤其是早产儿可能发生溶血性贫血。
引起孕期疾病
孕妇缺硒会免疫能力下降，从而容易受到细菌的感染引起身体不适。有的还可能会引起妊娠高血压和先兆子痫。
影响胚胎发育
硒能激活体液免疫，提高免疫功能，可对抗汞、铅、砷等有毒元素的毒副作用，防止镉引起胎盘坏死。如果孕妇缺硒的话，可能使胚胎发育不良、畸形。
导致胎儿发育迟缓
孕妇缺硒胎儿也会跟着缺硒，而胚胎活胎儿缺硒，会导致谷胱甘肽过氧化物酶活性降低，脂代谢紊乱，抗自由基的能力减弱，自身保护机制降低，使得胚胎发育受阻，从而导致胎儿宫内发育迟缓。
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