神经科主要治疗的疾病常见的有头痛、头晕、睡眠障碍等。目前对人们的健康以及生活质量威胁比较大的神经科疾病是脑血管疾病，包括短暂性脑缺血发作、脑梗塞、脑出血等。
神经科还治疗神经系统感染性疾病如脑炎、脑膜炎，脱髓鞘疾病如多发性硬化、视神经脊髓炎，以及周围神经疾病如三叉神经痛、面神经炎，神经系统变性疾病如阿尔兹海默病、帕金森病等。
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