第一、法正功劳太大、地位太高，智谋过人，诸葛亮知道自己没有这个实力
从公元208年法正与张松定计到公元214年刘备攻取益州，法正辅佐刘备取得了巨大的成功，使得刘备集团实力大增，因为刘备名义上占领荆州七个郡，实际上除了曹操战领的一部分外，只有长沙、零陵、桂阳、武陵四个郡属于刘备，后来还迫于形势将长沙、桂阳、零陵三个郡又归还东吴孙权，而刘备在攻取益州的十个郡后，地盘和兵员都迅速扩大，在这六年中，法正所起的作用是任何人都无法比拟的。
所以，刘备在夺取成都后，封法正为蜀郡太守，扬武将军，外统都畿，内为谋主(相当于现在的北京军区司令员兼北京市委书记而且还兼任中央军委总参谋长)，而诸葛亮被封为军师将军、署左将军府事，地位不比法正高，功劳没有法正大。
217年，正说先主曰：“曹操一举而降张鲁，定汉中，不因此势以图巴、蜀，而留夏侯渊、张郃屯守，身遽北还，此非其智不逮而力不足也，必将内有忧逼故耳。今策渊、郃才略，不胜国之将帅，举众往讨，则必可克。〔克之〕之日，广农积谷，观衅伺隙，上可以倾覆寇敌，尊奖王室，中可以蚕食雍、凉，广拓境土，下可以固守要害，为持久之计。此盖天以与我，时不可失也。”先主善其策，乃率诸将进兵汉中，正亦从行。
219年，先主自阳平南渡沔水，缘山稍前，於定军、兴势作营，渊将兵来争其地，正曰：“可击矣。”先主命黄忠乘高鼓噪攻之，大破渊军，渊等授首。曹公西征，闻正之策，曰：“吾故知玄德不办有此，必为人所教也。”
先主立为汉中王，以正为尚书令、护军将军(相当于国务院秘书长、中央书记处书记兼中央军委总政治部主任)，明年(220年)卒，时年四十五，先主为之流涕者累日，谥曰翼侯。赐子邈爵关内侯，官至奉车都尉、汉阳太守。
诸葛亮与正，虽好尚不同，以公义相取。亮每奇正智术。先主既即尊号，将东征孙权以复关羽之耻，群臣多谏，一不从。章武二年，大军败绩，还住白帝。亮叹曰：“法孝直若在，则能制主上，令不东行，就复东行，必不倾危矣。”
先主与曹公争，势有不便，宜退，而先主大怒不肯退，无敢谏者，矢下如雨，正乃往当先主前，先主云：“孝直避箭。”正曰：“明公亲当矢石，况小人乎？”先主乃曰：“孝直，吾与汝俱去。”遂退。评曰：庞统雅好人流，经学思谋，于时荆、楚谓之高俊，法正著见成败，有奇画策算，然不以德素称也，儗之魏臣，统其荀彧之仲叔，正其程、郭之俦俪邪？
由此可见法正智谋深远，胆识过人，可以与曹操手下的首席谋士郭嘉相媲美，诸葛亮自叹不如，其实根本没有实力、没有能力处罚法正，因为在当时的情况下他根本不是法正的对手。
第二、法正是原益州刘璋部下投靠刘备的领军人物，代表原来益州旧有统治集团的既得利益
在刘备刚刚夺取益州立足未稳的情况下，需要团结以法正为代表的李严、刘巴、黄权、吴懿、孟达等新近归降的旧势力，为刘备集团效力，以共同对付曹操和孙权，刘备之所以接受法正的建议娶吴懿的女儿为夫人(后被封为皇后)，就是为了团结一切可以团结的力量，搞好统一战线，在这种情况下恐怕就连刘备也不敢轻易对法正下手，诸葛亮又怎么敢与法正为敌呢？
第三、法正深受刘备的信任和倚重
三国志载：“亮又知先主雅信正，故言如此。”也就是说诸葛亮的老板对法正非常的信任倚重感激，诸葛亮不过是给刘备打工的而已，老板不发话，诸葛亮自然也不愿意与法正为敌，自讨没趣。
综合以上因素，我认为诸葛亮之所以不敢惹法正实在是有着多方面的深层次的复杂原因，正因为如此诸葛亮才不能不敢不愿处罚法正，因为法律也罢、军事也罢、战争也罢，都必须服务于联吴抗曹、夺取天下、兴复汉室的政治大局，诸葛亮首先是一个卓越的政治家，因此他的做法自然也在情理之中。
其实诸葛亮不是不想收拾法正，只是力量不足，形势不允许，时机不成熟罢了，以法正飞扬跋扈、睚眦必报的性格和所作所为，刘备最终不可能托孤给他，甚至在其生前必然会除掉法正，因为他必须为扶不起的性格懦弱的刘禅扫除一切障碍。
只是法正在220年就死去了，享年45岁，第二年221年刘备才称帝，所以诸葛亮才没有机会与法正争夺蜀汉的最高统治权，否则鹿死谁手还真是尚未可知！
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